由於腸病毒型別很多，無法得過一次就終身免疫，而且目前並沒有疫苗可以預防（小兒麻痺除外），又可經口、飛沫及接觸等途徑傳染，控制不易，故民眾應注意下列預防方法：
一、高危險群：三歲以下小孩要特別小心，有較高比率得到腦炎、類小兒麻痺症候群或肺水腫。
二、增強個人之免疫力：注意營養、均衡飲食、適當運動及充足睡眠。
三、加強個人衛生：正確且勤加洗手，以預防自身感染，及避免藉由接觸傳染給嬰幼兒。
四、注意環境衛生：保持環境清潔及通風。
五、避免接觸受感染者：避免出入過度擁擠之公共場所，不要與病患（家人或同學）接觸。
六、如有疑似腸病毒感染症狀請儘速就醫。
七、家中有病患時應注意：
（一）小心處理病患之排泄物（糞便、口鼻分泌物），且處理完畢應立即洗手。
（二）多補充水分，學童儘量請假在家休息，以避免傳染給同學。
（三）對家中之第二個病患要特別小心，其所接受的病毒量往往較高，嚴重程度可能提高。
（四）有下列情況需立刻就醫：
1.有嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力應即早就醫，一般神經併發症是在發疹二至四天後出現。
2.肌抽躍（類似受到驚嚇的突發性全身肌肉收縮動作）。
3.持續嘔吐。
4.持續發燒、活動力降低、煩躁不安、意識變化、昏迷、頸部僵硬、肢體麻痺、抽搐、呼吸急促、全身無力、心跳加快或心律不整等。
5.患者應避免與孕婦、新生兒及小孩接觸。

訊息交流
春夏交替，呼吸道傳染病活躍，請注意預防嬰幼兒與學童感染。
呼吸道傳染病是致病原從人的鼻腔、咽喉、氣管和支氣管等呼吸系統管道侵入，感染人體而引起的疾病，常見的致病原有細菌與病毒。呼吸道傳染病依致病原特性，一年四季都有感染個案發生，目前處於春夏交替之際，以腸病毒、猩紅熱等最為常見。由於前述傳染病多發生於抵抗力較弱的嬰幼兒，且容易在同儕接觸密切的學童間傳播，疾病管制局提醒家長與教保育人員，務必注意防範，以保障嬰幼兒與學童的健康。
由於呼吸道傳染病可經由飛沫或空氣傳播，其中腸病毒也可透過糞口或接觸途徑傳染，傳染性很強，加上臺灣地區人口稠密，更容易助長傳播。該局表示，要預防呼吸道傳染病其實不難，只要在日常生活中，落實「養成良好的個人衛生習慣」及「時時正確洗手－溼、搓、沖、捧、擦」等衛生保健習慣，就可大幅降低感染的機會。

嬰幼兒遭受感染的來源多來自家中成人或較大孩童，雖然成人或較大孩童感染後，通常沒有症狀或症狀輕微，但對於嬰幼兒則可能造成嚴重的病情，所以嬰幼兒保育人員及家中有嬰幼兒的家長，務必注意自身及其他較大孩童的衛生，尤其自外返家，在接觸幼兒前，務必更衣洗手，以免將致病原傳染給免疫系統尚未發展成熟的嬰幼兒，也要避免攜帶嬰幼兒出入人潮擁擠、空氣不流通之公共場所，或到醫院探病。

除了家庭以外，學校也是呼吸道傳染病傳播的主要場所，學童若感染，最好請假在家休息至少一星期，並避免接觸家中幼兒，也最好不要前往安親班；若不克請假，最好配戴口罩，並與其他學童適度區隔，以免將致病原傳給他人，造成疫情擴大。

該局還要提醒民眾，為避免感染後出現後遺症或併發症，嬰幼兒與學童若經醫師診斷遭受感染，請務必遵照醫師指示，多休息，按時服藥，確實完成必要的療程，才能早日恢復健康。